Существовавший прежде деревянный Преображенский храм сгорел в 1785 году. Но в документах 1681-1683 годов есть упоминания о «Спасском попе Корнилии Микулаеве» и «священнике Преображения Господнего Михаиле Матвееве». Следовательно, это был один из первых Ахтырских храмов, когда началось заселение этих мест беженцами из-за Днепра в середине XVII века.

Новый деревянный Преображенский храм был построен в 1790 году особой заботливостью священника Якова Назаревского. Следует отметить, что потомки протоиерея соборного храма Назария Яковлевича (+1723г.) Назарьевы и Назаревские долго и с честью служили Ахтырским храмам. Сыновья его Григорий Назарьев был протоиереем Никольского храма, Андрей – Покровским священником, Яков – Спасским, внук Стефан Григорьевич – Никольским, другой Василий Яковлевич – также Никольским.

По Справочной книге для Харьковской епархии за 1904 год Преображенскому храму принадлежало 4 десятины и 1200 кв. саженей пахотной земли. К храму были приписаны хутора Высокий и Велико-Озерский. Прихожан было 626 м.п. и 635 ж.п. Неприкосновенный церковный капитал составлял 300 рублей, причта – 1000. В хуторе Высоком была школа грамоты. По штату было положено: священник и псаломщик.

Церковный староста с 1887 года – купец Федор Гожиенко.

В начале 1904 года был одобрен и принят проект нового каменного Спасо-Преображенского храма, который был построен в 1905 году и освящен 13 ноября того же года. В «Ведомостях о церкви Спасо-Преображенской г.Ахтырки за 1909 года» - архивном документе Харьковской духовной консистории – сказано: «Церковь в одной связи с колокольнею построена в 1905 году Усердием и на пожертвования Григория Федоровича Чикало…».
С 1920 по 1935 годы священником Спасо-Преображенской церкви служил о. Сергий Николаевский, происходивший из старого рода священников Николаевских.